سافرانین یک رنگ کاتیونی است که در بافت شناسی و سیتولوژی برای تشخیص و شناسایی بافتها و سلولهای مختلف استفاده میشود. از این ماده در تحقیقات پزشکی جهت رنگ آمیزی پروتئوگلیکانهای اسیدی موجود در بافتهای غضروف استفاده میگردد و محققان را قادر میسازد تا غضروفزایی سلولی را به طور دقیق مورد بررسی قرار دهند.
این رنگ همچنین به عنوان ضد رنگ در رنگ آمیزی اندوسپور و رنگ آمیزی Gram استفاده میشود. این ماده بیشتر در شناسایی غضروف، موسین و گرانول سلولهای mast cell کاربرد دارد.
رنگ سافرانین با اتصال به پروتئوگلیکانهای اسیدی در بافتهای غضروفی با میل ترکیبی بالا و تشکیل کمپلکس نارنجی مایل به قرمز عمل میکند. اتصال بافتهای غضروفی که در زیر میکروسکوپ مشاهده می شود قرمز به نظر می رسد.